| יחידת־הוראה | שם | הנחיה לפעילות |
|---|---|---|
עליכם להגיש תקציר ברור ופורמלי על נושא לפי בחירתכם, שקשור לנושאי הקורס (אלגוריתמים בביולוגיה חישובית, עדיף עם רצפים). על התקציר להיות יסודי ומעמיק, באנגלית, כולל סקיצות או שרטוטים, בהיקף של בערך 2500-3000 מילים (5-6 עמודים). אפשר לכתוב על נושא שמופיע בספר הקורס (דרבין וחברים, ניתוח רצפים ביולוגיים), או על מאמר שאהבתם, או על נושא אחר. נא לאשר את הנושא מול תומי לפני תחילת העבודה. |
||
| שבוע 1 - ניסוח שאלת מחקר ועימוד זוג רצפים | ||
| שבוע 2 - עימוד זוג רצפים והכרעה | ||
| שבוע 3 - שערוך פרמטרים | ||
| שבוע 4 - מודלים מרקוביים ושרשראות מרקוב חבויות | ||
| שבוע 5 - ויטרבי וזיהוי מוטיבים ברצפים ביולוגיים | ||
אתם מוזמנים לצפות עד דקה 40 בערך |
||
| שבוע 6+7 - מודל מרקובי בזמן רציף | ||
| שבוע 8 - מתילציה ואריזת הגנום + דנ"א חופשי | ||
| שבוע 9 - ספקטרומטריה של מאסות - ד"ר ניר קליסמן |